Основные направления деятельности учреждения: 1. Контроль качества природных сред на территории республики;

2. Аналитическое сопровождение мероприятий государственного экологического надзора, в т.ч. при залповых сбросах, выбросах загрязняющих веществ на объекты природной среды;

3. Реализация плана мероприятий по организации комплексного экологического мониторинга, в т.ч. превентивного мониторинга на территориях крупных инвестиционных проектов, в зоне влияния действующих промышленных предприятий;

4. Оценка фонового состояния природных сред, в т.ч. и на ООПТ;

5. Исследования природных сред по обращениям отдельных граждан и населения, глав администраций МО и др. Лабораторные химико-аналитические исследования состояния атмосферного воздуха, поверхностных и подземных вод суши, почвенно-растительного покрова на территории Республики Саха (Якутия), характеризующих качество окружающей среды, а также показателей негативного воздействия на окружающую среду со стороны объектов хозяйственной и иной деятельности.